微生物在人们日常生活、学习、科研中随处可见，也同每个人息息相关，经过多期培训以及学员反馈，特开设更为贴合科研工作者、初学者的需求的微生物主题培训。课程分为三部分：
第一部分以理论概念讲述、课题设计、文献分享为主，主要目的是帮助科研工作者把握领域的基本情况、了解领域热点问题、从而可以独立进行课题设计与实验计划安排，以演示为主；
第二部分以操作逻辑讲解、报告解读、文章优化为主，主要目的是帮助科研工作者串联基本的分析脉络、整理文章图表进行文章优化，以演示和操作为主；
第三部分以实际编程操作、上机练习为主，主要目的是帮助时间较为充足的科研工作者实现从分析的初级结果中提炼出有效信息，整理出图表，深入理解编程软件的基本用法，以演示、操作和练习为主。
其中，第一部分和第二部分主要面向涉及课程设计的科研工作者，第二部分和第三部分主要面向即将进入该领域，有大量精力可以用来学习的学生。
课程目的
1. 掌握相关的基础知识；
2. 掌握微生物学和微生物组学的基本概念；
3. 掌握扩增子测序技术、宏基因组、宏转录组、宏代谢组测序技术的基本概念、分析逻辑；
4. 掌握相关文章逻辑把握和呈现形式，以及相关的分析技能。
主讲专家
邀请一直从事微生物组研究的教授、研究员等专家，有丰富的系统性科研训练经历和授课经验，任职于北京各高校和研究所，有Nat. Commun.、Nucleic Acids Res.、Gut、Genome Biology等国际顶级刊物多篇文章发表。
培训时间
2023年10月20-22日，上午9:30-12:00，下午13:30-18:00
北京市海淀区丰贤中路7号3号楼
课程大纲
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微生物与微生物组课题设计与高通量测序数据分析培训班课程目录 |
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第一章 微生物与微生物组研究理论基础 |
1.1 微生物与微生物组研究背景与现状 1.2 基因组学与微生物组学 1.3 微生物组研究项目设计 1.4 微生物组研究文献综述 |
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第二章 生物信息学在微生物组研究中的应用 |
2.1 生物信息学背景介绍 2.2 常用参考数据库介绍 2.3 常用微生物基因组分析流程介绍 2.4 常用微生物组分析流程介绍 2.5 常用软件使用介绍与练习 2.6 应用案例与课后练习 |
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第三章 微生物组扩增子测序方案及结果解读 |
3.1 16S/ITS扩增子研究方案介绍 3.2 分析报告解读 3.3 扩增子测序分析文献详解 |
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第四章 微生物组宏基因组测序和宏转录组测序方案及结果解读 |
4.1 宏基因组、宏转录组、宏病毒组、宏代谢组研究方案介绍 4.2 分析报告解读 4.3 宏基因组、宏转录组、宏病毒组、宏代谢组文献详解 4.4 整合型研究文献分析详解 |
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第五章 R语言在微生物组研究中的应用 |
5.1 编程基础简介 5.2 R语言基础与练习 5.3 R语言的统计与绘图 5.4 R语言在微生物组研究中的应用案例 5.5制图软件优化 |
注：以上为课程主要内容，并非课程安排，课程安排顺序会根据面向科研工作者的类型有差异。
分享的案例以CNS子刊microbiome，ISMEJ，genome biology等为主，并结合学员实际情况进行适当调整。
主办单位
北京市计算中心有限公司
协办单位
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
工业和信息化人才培养工程培训基地
北京市大数据教学实践基地
报名费用
注册费：3900元/人（含当期听课费、资料费、证书费），开具发票，提供盖章通知。
3人以上参加每人优惠300元，不与其他政策共享。
报名回执
报名咨询
徐建美，18701529461
员丽丽，18701529461（微信同）
