2022.04.18-22 实用生物信息学研讨班

实用生物信息学研讨班

如您所知，近年来，以基因组科学为代表的研究工作和技术平台先后获得各项资助，如国家863计划、973计划、中国科学院知识创新工程、国家重大攻关项目、自然科学基金等。为了辅助广大科研工作者掌握高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能，我中心特举办此“实用生物信息学研讨班”。

主办单位：北京市计算中心有限公司

协办单位：

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

工业和信息化人才培养工程培训基地

北京市大数据教学实践基地

举 办 地：北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排：2022年4月18日-22日（周一--周五）上午9:30-11:30 下午13:30-17:00

时间	主题	授课内容	备注
第一天	组学及生物信息学概述	1、组学研究概述（基因组学，转录组学，表观组学，蛋白质组学，代谢组学及相关技术介绍） 2、实验设计及测序原理 3、生物信息学背景知识介绍	理论
	Linux服务器使用入门	4、掌握Linux系统下的常用命令（重点讲解） 5、掌握linux环境下软件的安装使用 6、了解shell脚本的编写	实操
	R语言入门	7、R语言简介 8、R语言安装及配置 9、R语言数据结构 10、R语言数据处理 11、R语言绘图	理论+实操
第二天	转录组数据分析实例	12、转录组技术发展前沿动态 13、转录组应用案例及应用热点 14、常用的转录组实验设计及测序建库技术	理论
	转录组数据分析实例	15、转录组分析方法介绍	理论
	转录组数据分析实例（上机操作）	16、转录组数据准备和软件介绍及安装 17、转录组数据的比对（重点讲解） 18、表达量估计和分析（重点讲解）	理论+ 实操
第三天	基因组重测序与数据分析	19、讲解基因组重测序的概念、目的与应用 20、结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识	理论
	基因组重测序数据分析实例（上机操作）	21、对二代测序数据的解读 22、数据质量控制及数据过滤 23、使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化（重点讲解） 24、寻找SNP和Indel并进行注释（重点讲解） 25、寻找结构变异并对变异进行注释（重点讲解）	理论+ 实操
第四天	microRNA测序与数据分析	26、microRNA的定义、应用和发展 27、microRNA的生物学过程 28、microRNA研究的实验设计及测序原理	理论
	microRNA测序与数据分析	29、microRNA测序数据分析软件（重点讲解） 30、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景 31、microRNA测序数据分析案例展示（重点讲解） 32、近期文献	理论
	microRNA数据分析实例（上机操作）	33、microRNA测序数据预处理（重点讲解） 34、测序数据长度分布计算 35、microRNA的预测（重点讲解） 36、microRNA碱基偏好性计算 37、microRNA靶标基因预测，结果提取、统计（重点讲解）	理论+ 实操
第五天	10×单细胞转录组测序数据分析原理	38、单细胞测序技术研究现状及应用 39、单细胞转录组实验设计及建库测序原理（重点介绍10x genomics） 40、空间转录组实验设计及建库测序原理	理论
	10×单细胞转录组测序数据分析流程上机操作	41、10×单细胞软件Cellranger处理测序原始数据实操 42、R包Seurat细胞分群、umap、t-sne、marker基因筛选实操	实操
	蛋白结构与互作分析	43、PyMol    44、Cytoscape	实操

注：内容以实际发生为准；若调，会提前通知。

【报名费用】

注册费：5400元/人（含当期听课费、资料费、证书费、考试费（如有））。培训期间，食宿自理。

提供当期视频回放以供复习使用（羽林学院平台）。

开具增值税发票，提供盖章通知、结业证书等相关材料。

【报名优惠政策】

1、3人以上团体报名每人可减少300元；

2、4+1团报，可免费赠送一个名额；

3、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种；

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。

【付费方式】

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称：北京市计算中心有限公司

账号：0200151819100023937

开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

（汇款信息备注：“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称）

注：款项支出后，请提供付款回执给工作人员，方便核实到账、开具发票。

【咨询请联系】

QQ号：2814500767

邮箱：bcc-sxpx@bcc.ac.cn

徐老师 010-59341786，15801436028（微信同号）

员老师 010-59341773，18701529461（微信同号）

【注】开课前一周会发送邮件通知；若未接到邮件通知，请电话咨询。