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近期预告

2022.03.09-11 生物大数据时代的网络药理学研究模式学习班


生物大数据时代的网络药理学研究模式学习班

网络药理学1.jpg

人工智能以及云计算技术的快速发展,精准医学与医学大数据在生命科学领域的作用越来越明显。在人工智能的潮流中,中医药也迎来了新的发展契机。网络药理学是人工智能和大数据时代药物系统性研究的新兴、交叉、前沿学科,强调从系统层次和生物网络的整体角度出发,解析药物及治疗对象之间的分子关联规律,被广泛应用于药物和中药活性化合物发现、整体作用机制阐释、药物组合和方剂配伍规律解析等方面,为中药复杂体系研究提供了新思路,为临床合理用药、新药研发等提供了新的科技支撑。

在大数据背景下,随着网络药理学的影响力和应用日益广泛,网络药理学在理论分析、算法发展和实际应用等方面,面临着重要的发展机遇和挑战。整合临床、实验的海量数据,结合科学验证,揭示药物对疾病的调控机制,是网络药理学研究的主要任务。

网络药理学2.jpg

中医药是中华民族的宝贵财富,在疾病防治方面具有独特的优势。中医整体观与以网络和系统为特征的新一代医学研究范式相吻合。中医提出了一种全新的“网络靶标”方法,即网络药理学的核心理论和方法。中医也是网络药理学的一个重要研究对象。中医网络药理学,旨在了解复杂疾病、中医证候和中药治疗的网络生物学基础,在网络药理学的起源和发展过程中起着至关重要的作用。

网络药理学3.jpg 

为更好地了解网络药理学的新进展,包括预测中药靶标,了解疾病和证候的生物学基础,中药方剂的网络调控机制,以及基于生物网络的疾病和证候标志物的识别。这些研究呈现出计算、实验和临床相结合的趋势,是未来中药网络药理学研究的一个很有前途的方向。北京市计算中心生物计算事业部特举办“生物大数据时代的网络药理学研究模式研讨班”。培训班由北京市计算中心的一线分析工程师授课,通过技术讲座结合实验操作,展示应用实例,现场解答技术疑问,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平和竞争力。

授课对象:生物信息学学员,高校生物、药学相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员

电脑要求:64位windows10操作系统,运行日常程序流畅。

主办单位:北京市计算中心有限公司

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

工业和信息化人才培养工程培训基地

北京市大数据教学实践基地

  地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:2022.03.09-11(周三--周五)上午9:30-11:30   下午13:30-17:00

时间

主题

授课内容

备注

第一天

主题1:网络药理学研究思路

1、网络药理学的发展历程和研究现状简介
2
、网络药理学SCI论文研读分析
3
、网络药理学的研究思路及技术路线

理论

第一天

主题2:网络药理学的数据来源

4、中药有效成分查找和获取
1)常用中药数据及使用:TCMIDYaTCMTCMSP
2)小分子化合物结构信息查询:PubchemDrugbank
5
、中药所治疗疾病的相关基因查找和获取
1)人类疾病与基因遗传变异数据库:OMIM
2)疾病相关的基因与突变位点数据库DisGeNet
3)人类基因数据库:Genecards
4)治疗靶标数据库:TTD
6
、中药有效成分靶点的查询及获取
(1)
中药有效成分靶点的预测:SwissTargetPrediction
(2)
基于有效成分结构特征靶点预测:PharmMapper
(3)
蛋白结构数据库及结构数据的筛选和获取:PDB
(4)
中药有效成分靶点的获取:反向虚拟筛选方法

理论+实操

第二天

主题3:网络药理学数据整理及分析

7、中药分子机制研究的在线生物信息学分析工具: BATMAN-TCM
8
、中药高通量实验和参考数据库:Herb
9
、中医药证候关联数据库:SymMap
10
、细胞代谢及信号传导通路数据库:KEGG
11
、蛋白质互作网络查询和可视化分析:STRING
12
、化合物与蛋白质互作:STITCH
13
、富集分析数据库:DAVID
14
、基因/蛋白质功能注释和功能集富集分析:?Kobas数据库

理论+实操

第三天

主题4.网络药理学数据可视化

15、网络分析软件:Cytoscape
1)分析数据导入与导出
2)基本拓扑特征计算
3)重要节点识别
4)网络拓扑指标含义
5)子网络提取
6)网络可视化
7)图形导出
8Cytoscape插件的安装和使用

理论+实操

第三天

主题4.网络药理学数据可视化

16、综合性分析软件:IPA
1)基于IPA经典通路分析
2)基于IPA疾病与功能分析
3)基于IPA生物分子网络构建
4)基于IPA的因果网络分析
17
、分子对接及相互作用分析
1)对接软件的介绍及安装
2)小分子和蛋白结构文件的预处理
3)蛋白活性位点的确定
4)分子对接流程的介绍及实操
6)分子对接结果相互作用分析及可视化

理论+实操

注:内容以实际发生为准;若调,会提前通知。

报名费用

注册费:4200元/人含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。培训期间,食宿自理

提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

报名优惠政策

13人以上团体报名每人可减少300元;

24+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款现场刷卡

单位全称:北京市计算中心有限公司

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

报名回执

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咨询请联系

QQ号:2814500767

邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn

徐老师 010-59341786,15801436028(微信同号)

员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)

开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。


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