还在认为没有实验就不能发表论文？
手头有很多数据，不知道该怎么进一步挖掘？
还在为不知道如何找靶点而苦恼？
还在为不精通挖掘GEO、TCGA等数据库而痛苦不堪？
还在为不会那些高大上的图表而暗自伤神？
快来参加北京市计算中心举办的生物医学公共数据深度挖掘及应用培训班吧！
本次培训对目前公共数据挖掘热点进行系统介绍，提供一次性系统了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等数据库数据产生、分析及挖掘的课程。通过大量演练操作，帮助科研人员利用这些公共数据库挖掘多组学数据，以便为自身科研项目服务。欢迎大家报名参加。
授课对象：
从事生物医学研究的临床医生、转化研究科研人员；
课题经费不足，无法进行大规模测序，但需要发表SCI论文的相关研究人员；
已获得转录组、基因组等多组学数据，需要进一步挖掘分析人员；
对生物医学大数据分析与挖掘感兴趣的其他人员。
培训效果：
短、平、快，为基金申请保驾护航，发表paper如虎添翼；
掌握多组学数据分析核心技能，GEO、TCGA、SRA数据处理没有压力；
科研绘图：以一敌百，高端大气，私人订制；
一套数据多角度演练，更易掌握分析思路。
主办单位：北京市计算中心
协办单位：北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地
北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地
线上直播主题安排及时间安排：2020年3月28-4月3日
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讲次安排 |
直播主题 |
时间安排 |
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第一讲 |
公共数据库挖掘热点介绍 |
3月28日(周六：上午9:30-12:00) |
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第二讲 |
常用生物医学数据库介绍 |
3月29日(周日：上午9:30-10:30) |
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第三讲 |
R语言基础 |
3月30日(周一：下午2:00-4:00) |
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第四讲 |
基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（一） |
3月31日(周二：下午2:00-4:00) |
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第五讲 |
基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（二） |
4月1日(周三：下午2:00-4:00) |
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第六讲 |
基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（三） |
4月2日(周三：下午2:00-3:00) |
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第七讲 |
多组学数据联合分析演练（一） |
4月3日(周三：上午9:30-11:30) |
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第八讲 |
多组学数据联合分析演练（二） |
4月3日(周三：下午2:00-4:00) |
线上直播课程内容安排如下：
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时间安排 |
授课题目 |
授课内容 |
主讲 |
时长 |
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第一讲 3月28日(周六) |
公共数据库挖掘热点介绍 |
1、疾病诊断biomarker鉴定 2、疾病预后biomarker鉴定 3、可变剪切与预后相关分析 4、肿瘤免疫分析 5、多组学泛癌症分析 6、人工智能研究在病理切片识别上的应用 7、人工智能多组学数据整合分析 |
闻少楠 裴智勇 |
2.5h |
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第二讲 3月29日(周日) |
常用生物医学数据库介绍 |
1、用生物医学数据库介绍： 1）大型综合数据库：NCBI、UCSC 2）公共高通量测序数据库：SRA 3）公共基因表达谱数据库：GEO 4）公共癌症多组学数据库：TCGA 2、各大数据库数据下载 |
袁寒玉 |
1.5h |
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第三讲 3月30日(周一) |
R语言基础 |
1、R语言简介 2、R语言安装及配置 3、R语言数据结构 4、R语言数据处理 5、R语言绘图 |
李怡辰 |
2h |
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第四讲 3月31日(周二) |
基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（一） |
1、差异表达分析及结果可视化： 1）edgeR包使用 2）火山图绘制 3）聚类热图绘制 2、GO、KEGG功能富集分析及结果可视化： 1）GO富集分析 2）KEGG富集分析 3）富集分析气泡图绘制 |
袁寒玉 |
2h |
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第五讲 4月1日(周三) |
基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（二） |
1、利用string数据库查询基因/蛋白相互作用 2、利用cytoscape工具构建相互作用网络 3、网络拓扑结构分析、关键基因识别 |
刘书霞 |
2h |
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第六讲 4月2日(周三) |
基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（三） |
预后相关性分析、生存曲线、ROC曲线绘制： 1）利用R包进行单因素及多因素预后分析 2）生存曲线绘制、生存曲线差异显著性分析 3）RISK score计算及结果可视化 |
袁寒玉 |
1h |
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第七讲 4月3日(周三) |
多组学数据联合分析演练（一） |
甲基化与转录组整合分析思路演练： 1）甲基化数据预处理 2）差异甲基化位点及区域识别 3）甲基化与转录组数据联合分析 4）公共表观数据库：ENCODE、regulomeDB |
杨宇 |
2h |
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第八讲 4月3日(周三) |
多组学数据联合分析演练（二） |
lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练： 1）lncRNA表达谱数据获取 2）miRNA靶基因分析 3）lncRNA与mRNA表达相关性分析 4）ceRNA网络构建及结果可视化 |
杨宇 |
2h |
具体领取方式：
1、各位老师可先扫码报名，填写报名信息。
2、付完费用后，截图发至工作人员微信或邮箱.
3、我们的工作人员会在线上课开始前一个小时将直播链接发至您邮箱或微信。
4、收费标准：
1）微生物专题课程：3500元。赠送同等价值线下班名额一个。
2）按年付费，全年线上课程费用为4.5万元（含一年资源使用账号一个，线下培训名额2个）。
可开培训费、会议费、会议注册费，提供邀请函、结业证书等相关材料。
直播结束后，将上课期间用到的数据、ppt资料、脚本、视频等相关文档，通过硬盘邮寄的方式快递到您手上，便于您后续继续学习使用。
5、支付方式：微信或支付宝扫码缴费、银行转账。
微信或支付宝扫码缴费 汇款账号信息
6、报名咨询方式
徐老师 010-59341786，15801436028（微信同号）xujm@bcc.ac.cn
员老师 010-59341773，18701529461（微信同号）yuanll@bcc.ac.cn
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